Las primeras manifestaciones de atletismo en Puerto Rico se celebraron a finales del siglo XIX, antes de la Guerra Hispanoamericana, pero no es hasta las primeras décadas del siglo XX que podemos señalar el origen y desarrollo del deporte Rey en el país. Las primeras competiciones celebradas en Puerto Rico fueron organizadas por el Departamento de Instrucción a partir del año de 1902 para la población escolar. Durante las primeras décadas del siglo XX los Juegos Interescolares resultaron ser la competencia de atletismo de mayor trascendencia en Puerto Rico.

En el año de 1927 se crea la Liga Atlética Interuniversitaria , mejor conocida por sus siglas como la LAI, con la participación de la Universidad de Puerto Rico, el Colegio de Mayagüez y el Instituto Politécnico de San Germán . En la época actual cuenta con doce instituciones educativas que participan de la LAI. La competencia de atletismo universitario conocida como las Justas es el evento de mayor tradición y auge del atletismo puertorriqueño contando con año tras año con la mayor asistencia de espectadores. Las Justas han contribuido significativamente con el atletismo puertorriqueño ya que la mayoría de nuestros representantes a competiciones internacionales han sido desarrollados en las universidades.

Mientras en el año 1928 se organizaron los primeros clubes de atletismo en Puerto Rico. El primero fue el Ponce “Athletic Club” y luego el San Juan “Olympic Association”. La fundación de estos clubes de atletismo crean las condiciones para la primera competición de atletas fuera del ámbito escolar y universitario.

La primera competencia internacional que Puerto Rico participó en el deporte de atletismo fueron los Segundos Juegos Centroamericanos y del Caribe celebrados en la Habana en el año de 1930. Resultando los primeros ganadores de medallas de plata los atletas Manuel Luciano en el evento de salto con pértiga y Eugenio Guerra en los 200 metros. Mientras la primera medalla de oro en el atletismo de los Juegos Centroamericanos y del Caribe la obtuvimos en el Salvador en el año de 1935 con el atleta Fernando Torres Collar en el evento de la bala. La primera participación de las féminas en el atletismo internacional fue en el año 1938 en los cuartos Juegos Centroamericanos y del Caribe celebrado en Panamá donde la atleta Rebekah Colberg ganó medallas de oro en los eventos del disco y la jabalina.

Resulta conveniente señalar que desde el año 1930 Puerto Rico ha participado en la mayoría de las competiciones internacionales de atletismo entre las que se encuentran: Juegos Centroamericanos y del Caribe, Juegos Olímpicos, Juegos Panamericanos, Campeonatos Iberoamericanos y Campeonatos Mundiales de Atletismo.

La creación de la Federación de Atletismo Aficionado de Puerto Rico es en el año 1947 bajo el liderato de Don Julio Enrique Monagas quien logró el ingreso como federación afiliada a la IAAF. Esta gesta constituyó una de las primeras integraciones de una federación deportiva del país en un organismo mundial. Su incorporación como entidad acreditada en el Departamento de Estado fue en el año de 1956 antes inclusive que el propio Comité Olímpico de Puerto Rico.

Desde la fundación de la Federación de Atletismo de Puerto Rico en el año 1947 al presente año del 2005 ha sido dirigida por nueve presidentes y una Junta Pro-tempore.